本发明公开了一种预防电动自行车自燃的控制方法，涉及电动自行车领域，该方法当根据电机控制器的正电源连接端子的电压以及逻辑电路电源端子的电压检测到正电源连接端子与动力电池断开时，和/或，当检测到满足预定电流波形条件的d轴电流和q轴电流而确定相线连接端子与电机的相线断开时，电机控制器关闭输出以切断动力。该方法通过控制算法可以有效地检测电机控制器中存在大电流的连接端子的松动现象，并在检测到出现松动现象时快速输出以切断动力，从而有效防止因为接触电阻上升产生局部过热而导致绝缘失败所引起的，从而有效预防电动自行车自燃，提高了安全性。