本发明涉及一种纳米缓释微囊及其制备方法与应用。所述纳米缓释微囊以黄花蒿提取物、青蒿叶/茎提取物、紫灵芝提取物、何首乌根提取物、红参提取物、蔓荆提取物、龙胆根提取物、樟树叶提取物、茶籽提取物为囊芯活性物质，山梨醇硬脂酸脂、鲸蜡醇棕榈酸脂、月桂基葡糖苷、水为囊材。所述纳米缓释微囊为球形超细微囊，由双层油相脂质膜与水相膜所构成，粒径约为150～300nm。该纳米微胶囊可解决头屑、头痒、头皮缺乏滋养的问题，其内容物活性高、渗透性强、功效持久。