本申请提供了一种医疗数据处理方法和装置、电子设备及存储介质，属于人工智能及数字医疗技术领域。该方法包括：获取原始医疗数据中的第一医疗数据、第二医疗数据；对第一医疗数据进行分词处理，得到病情字符；根据医学词典和病情字符构建目标病情共现矩阵；将第二医疗数据映射至预设向量空间，得到第一文本向量；将第一文本向量与预设随机扰动因子进行拼接，得到第二文本向量；通过文本理解模型对第一文本向量、第二文本向量进行语义分析，得到第一文本隐藏特征、第二文本隐藏特征；通过病情特征、第一文本隐藏特征、第二文本隐藏特征计算病情词组的损失值，并根据损失值得到病情表征数据。本申请能够提高处理医疗数据的准确性。