本发明提供了一种双模式多通道交叉波导，包括包括衬底，所述衬底以上设有顶层硅，所述顶层硅包括呈正2N边形的优化区和N个交叉的通道，N≥3，所述通道的中心线沿正2N边形的边的垂直平分线设置，所述优化区沿正2N边形的对称轴被划分为4N个对称区，所述对称区上开设有空气孔，通过调整所述对称区上空气孔的状态，形成一个满足预定输出目标的非周期性打孔阵列，所述输出目标是指每个通道支持两种不同模式光传输；本发明提供的双模式多通道交叉波导尺寸小，性能好，能实现两种不同模式在任意通道传输的交叉功能，进一步增加光互连系统的传输容量。