本发明公开了融合在线学习的分层差分进化算法的虚拟机舱协作智能评估优化方法及系统，包括以下步骤：成员完成一次完整的评估，计算出科目内评估的成员的得分及其降衡得分；提取与当前时间相距一段时间内的评估数据，在线学习的方法将有效历史数据集按时间分批次处理，在衰减因子作用下对数据点执行过采样操作，降衡得分以高斯分布进行拟合；以目标高斯误差的评价指标最小化为进化目标，分层差分进化算法优化，达到所设置的最大函数评价次数；按得到的各评估科目间的权重分布情况，重新计算有效历史数据集内数据点对应的得分情况。本发明通过衰减因子的作用对数据点执行过采样操作，找到最小的权重从而使得评价结果离差最小，提高数据的合理性。