本发明提供了自动上纸箱系统，其能够根据上料的箱体工位的箱子数量进行上料位置设置，且快速转运到旁侧的升降机，使得纸箱上料高效稳定运行，且整套设备自动化运动、成本相对较低。其包括若干个独立布置的双层辊子机、若干个升降机、若干组换向输送机以及视觉系统；若干个双层辊子机沿着直线方向排列布置、形成双层输送线，相邻的双层辊子机之间用于输送纸箱；双层输送线的长度方向两端分别设置有一个升降机；双层输送线的中部位置设置有至少一个输送工位，输送工位的外侧设置有对应的升降机，输送工位所对应的双层辊子机上集成有换向输送机，换向输送机用于将输送工位上的纸箱换向输送至外侧的升降机、将纸箱送出双层输送线。