本发明提供一种双生态闸泄流控制系统，通过在大坝上设置双生态闸实现对下游的生态流量泄放，所述双生态闸均设置有启闭机，以实现对生态闸的控制，设置流量监测装置和第一开度传感器、第二开度传感器，以实现根据开度传感器和流量监测值，对相应的启闭机进行控制，实现自动优化控制，防止下游出现流量监测值不满足生态流量需求的工况，提高河流区域的生态环境，该控制系统结构简单，便于实施，可以提高控制效率。