本申请提供了一种深部背斜构造及地层结构三维数值模型构建方法，用于精确地构建一背斜构造的三维数值模型，从而为后续的有限元分析打造精确有效的基础。方法包括：获取目标背斜构造的初始数据，其中，初始数据是通过探洞或者钻孔的方式采集得到的，初始数据包括目标背斜构造的轴面几何参数、地层产状、地层组成以及地层结构；基于初始数据的内容，构建目标背斜构造的三维实体模型，其中，三维实体模型用于还原目标背斜构造的三维实体结构；采用非结构性六面体网格对三维实体模型进行剖分，并对其中的断层构造进行网格剖分，形成用于有限元计算的三维数值模型，其中，三维数值模型用于对目标背斜构造进行地质力学分析以及数值仿真分析。