本发明涉及一种基于双阶段回归的航空网络波及效应推断方法，属于航班延误预测技术领域，解决了现有延误传播分析模型固化且基于理想化假设建立的问题。包括构建各时间片所有机场间的邻接矩阵，生成各机场的延误状态向量；根据动力学函数库和邻接矩阵构建航班延误模型；根据延误状态向量，通过LASSO回归方法拟合航班延误模型，得到初步拟合方程；从所有机场中采样得到多个机场组合，采用加权赤池信息量准则对每个机场组合对应的初步拟合方程进行优化，得到每个机场组合对应的优化方程，基于各优化方程得到延误传播方程；根据延误传播方程得到所有机场在对应时间片的延误时间，作为航空网络波及效应的推断结果。实现了航空网络波及效应的准确预测。