本发明涉及卫星状态监测技术领域，公开一种卫星在轨故障传播和波及效应建模与预测方法及系统，以分析出卫星的故障传播路径并确保预测的精度。方法包括：收集卫星遥测参数历史数据；使用格兰杰因果关系模型判断卫星遥测参数之间是否具有格兰杰因果关系；基于互相关函数判断参数之间的格兰杰因果关系的相关强度、相关方向、滞后时间，剔除相关强度低于阈值的相关关系；根据剔除之后剩余的遥测参数之间的关系构造邻接矩阵，画出参数之间的因果关系图；根据遥测参数之间的邻接矩阵，应用解释结构模型，建立卫星遥测参数故障传播层级图；根据格兰杰因果关系模型，定量构造故障传播模型，根据故障传播模型来判断卫星故障发生的波及效应。