本发明公开了一种相位抖动采样方法，该方法基于可编程逻辑内部时钟周期，设计定时触发模块，产生预定时间间隔的触发脉冲信号，将触发信号送入的相位调整模块，相位调整模块以定时触发模块输出信号为输入，设置采样调整周期，每个调整周期中第一个采样周期调整一次相位，其余采样周期保持不变，每次增加一个时钟周期的相位偏移，当增加的相位总延迟达到设定的时钟周期时，则开始产生减少一个时钟周期的相位偏移，直到相位偏移为零，之后再重复此过程实现相位抖动采样。本发明通过对采样周期以及相位的设定调整，实现抖动相位的采样点在固定时刻采样点之间依次滑动，避免异常信号在两个采样点之间导致的信号丢失信息的问题。