本发明公开了一种总磷总氮连续在线监测方法及系统，该方法包括搭建线性回归模型步骤、获取线性回归系数样本步骤、扩大线性回归系数样本数量步骤、求取预测值步骤、寻找最优线性回归系数样本步骤、获取最优预测值步骤、校准线性回归模型步骤、连续监测步骤。本发明利用线性回归模型实现了总磷和总氮的在线监测，为了监测的准确性，在搭建好线性回归模型后，通过实测值的线性校准获取线性回归系数样本，并通过变异获取到更多的样本后通过大量样本对模型进行校准，从而提高了监测的精准度。同时通过不获取新的总磷总氮监测值来对线性回归模型进行持续修正，缩小监测结果和实际结果之间的差距。