本发明属于生物质燃料采样技术领域，尤其是涉及一种生物质燃料自动采样装置及其使用方法，包括：支撑组件、驱动组件、采样组件和存储组件，所述支撑组件包括箱体以及两根固定连接在箱体下端的第一竖杆，两根所述第一竖杆的侧壁上固定连接有同一个U形杆，所述U形杆的下端固定连接有与第一竖杆平行的第二竖杆，所述第一竖杆和第二竖杆的下端均连接有与地面接触的活动单元；所述采样组件包括三个固定连接在箱体侧壁上的采样筒管。本发明在采样前可以根据采样的范围对采样筒管的使用数量进行调节，即保证采样操作为随机同步进行，进而有助于提高采样的结构，并且在一处采样完成后可以快速的对装置整体位置进行调整以进行下一处采样。