本公开涉及一种复杂环境下的大气校正方法及系统，属于地基雷达大气校正技术领域。本公开通过提取永久散射体点并对其进行区域划分、三角剖分和大气相位插值获取大气相位估计结果，并在累积相位中将其去除实现大气校正，消除因地形和大气变化原因带来的形变测量不准确问题；进一步通过对永久散射体点进行二次精选，提升了永久散射体点选取质量；进一步通过双聚类和三角剖分的方法，解决了在复杂地形下插值参考点跨度过大或过于密集导致插值不可信或过拟合的问题；进一步通过反距离权重算法进行插值完成大气相位估计，使不同区域的大气估计结果更好地适应大气环境客观存在的局部多样性与空间连续性，提升大气校正和最后形变反演精度。