本实用新型涉及微生物发酵产物分离技术领域，公开了一种微生物发酵产物分离装置，包括底座，所述底座顶部左侧固定连接有支撑框架，所述支撑框架的顶部通孔内固定连接有发酵罐，所述发酵罐的底部出料口固定连接有出液管，所述出液管的底端固定连接在输送泵的进料端，所述输送泵的出料端固定连接在输送管的一端，所述输送管的另一端固定连接在分离罐的顶部左侧进料口内。本实用新型中，通过电机带动搅拌叶对发酵液和絮凝剂进行搅拌，加速发酵液与絮凝剂的混合，提高了混合的均匀性，有利于将液体中不易沉降的悬浮颗粒聚集成团，便于通过过滤网和透析膜进行过滤，实现将发酵产物与其他物质的分离，提高了分离的效果和效率。