本实用新型涉及微生物培养技术领域，特别是涉及一种多功能培养皿，包括皿盖和用于储存培养基的皿体，所述皿盖与皿体具有较好透气性的第一盖合状态和较好密闭性的第二盖合状态。在使用时，根据需要将培养皿设置为第一盖合状态或第二盖合状态，满足不同类型微生物生长的需要，使得培养皿具有更好的通用性。可将多组皿盖与皿体堆叠，之后一次下压实现多组培养皿的盖合，大幅简化了操作，更有利于批量操作。进一步的，皿盖具有半球面结构，与皿体盖合后的内表面设有亲水层，使蒸发的水汽易于聚集成滴，使皿盖不容易被水汽雾化，透过皿盖观察时具有一定的放大作用，可以观察到更小的微生物的生长，避免漏检，同时有利于观察微生物菌落的外观和形态。