本发明公开一种提高板倒换稳定性的方法和系统，该系统包括通过总线相连的控制单元、通信单元和保护单元，该通信单元和保护单元包括倒换控制模块和倒换处理模块，其中：该倒换控制模块，用硬件逻辑电路实现，在根据总线上的倒换信息判断需要倒换时，如根据同步标志判断该倒换处理模块空闲则马上通知其倒换，如该倒换处理模块正在处理上次倒换，则做倒换计数，在检测到同步标志变为空闲标志后再通知该倒换处理模块进行新的倒换；该倒换处理模块，在收到该倒换控制模块通知倒换的信息后，先设置表示正在倒换的同步标志，然后进行板倒换操作，在倒换完成后将同步标志设置倒换完成的标志。采用本发明可以提高板倒换的稳定性，并缩短倒换时间。