本发明公开了一种通信系统中实现千兆业务光通道主备倒换的方法及其系统，包括主用板及其交换系统和对端设备、备用板及其交换系统，还包括：设置于主用板上的主用板控制系统、主用板转换装置及设置于备用板上的备用板控制系统、备用板转换装置；主用板转换装置设置有千兆光口、千兆电口，备用板转换装置设置有千兆电口，且两个千兆电口相连接；主用板控制系统控制主用板转换装置将千兆电口信号转换成千兆光口信号，控制千兆光口信号或主用板交换系统的业务数据从千兆光口输出至对端设备；备用板控制系统控制备用板交换系统的业务数据从备用板转换装置的千兆电口输出至主用板转换装置的千兆电口。本发明实现了主备倒换过程中千兆业务通道自动倒换。