本发明揭示一种储存装置及其储存数据的保护方法。储存装置基本包含连接至一终端主机的一主机接口、连接至主机接口的一控制模块、以及连接至控制模块的一生物传感器及一存储器模块。控制模块令主机自动载入执行适合于主机的驱动程序及应用程序。主机通过这两程序接收来自使用者的一指令，以通知控制模块控制生物传感器读取使用者的一待辨识生物数据作处理并且萃取出待辨识特征数据。主机通过主机接口回送待辨识特征数据于控制模块中，由控制模块对比待辨识特征数据与储存于存储器模块的模板特征数据，并依据吻合结果使主机能存取存储器模块的一保密区块。本发明可在不增加硬件成本的情况下，达到数据保密的安全性及使用的方便性。