本发明公开一种保税物品监控系统及方法，该保税物品监控系统及方法与具有物流管理数据库的企业资源规划系统及具有报关管理数据库的报关系统连接，对待查物品进行追踪查询作业，该保税物品监控系统包括：物品追踪模块，以及物品核查模块，该保税物品监控方法包括：输入查询指令；接收物品数据；计算保税物品数据；对物品数据进行统计，产生物品进存耗数据表；根据物品进存耗数据表进行计算，产生理论库存数据；分别计算差异率；将该差异率与一预设差异率进行对比，在对比结果不匹配时产生异常信息；以及产生异常分析报告。本发明避免企业ERP数据与提供给海关的报关数据存在差异，确保企业报关顺畅，满足海关或管理单位对企业保税物品的监控要求。