本发明涉及分离与富集蛋白质的分子印迹树脂和制备方法，以克隆蛋白质为模板用辅助识别的限长聚合物链(识别分子)合成蛋白质印迹聚合物，具体地用于天然微量蛋白质的分离、富集。该分子印迹树脂可用于天然细胞提取物中目标蛋白质的分离、富集。本发明成球在有机相中进行，印迹在水相中进行，避免了对模板蛋白质的破坏，实用性强。以克隆蛋白质为模板的方法克服了天然微量蛋白质的印迹模板难以得到的瓶颈。使用十二烷基磺酸钠－聚丙烯酰胺凝胶电泳并以硝酸银染色检测吸附蛋白及其洗涤过程，这种检测方法灵敏度高，定量容易，直观准确。