本发明属于大豆深加工技术领域，特别涉及一种利用双酶法改性生产大豆分离蛋白的工艺。本发明采用低温脱脂豆粕为原料，在生产大豆分离蛋白过程中采用蛋白酶和酰基转移酶对大豆分离蛋白进行复合改性，提高产品的吸水性、保水性、吸油性和凝胶性。克服了单独使用蛋白酶进行酶法水解，与单独使用谷氨酰胺转胺酶进行分子间交联的缺点。本方法所得的产品在水中迅速分散并水解，无团粒，在肉制品加工中不堵塞注射针头，并且生产工艺简单，产品的功能性良好，在国内大豆分离蛋白在肉制品中需求量逐年增长的情况下，本发明具有良好的推广前景。