一种用于检测样品中核酸序列内某一特定位置是否存在多态性的方法，该方法包括：i)在基本不含有ATP的反应混合物中，使一对探针与该核酸序列退火，该对探针被设计为在退火时相互邻近，并且仅同一种形式的序列完全退火；ii)在NAD和核酸连接酶存在时，将任何完全退火的成对探针连接起来，该连接酶以NAD为底物；iii)将连接事件中释放的任何AMP磷酸化成ATP；iv)在得到的反应混合物中检测ATP，特别是使用生物发光反应。对实施该方法的试剂盒也进行了描述，并提出了权利要求。