一种用于自来水给水管道的脉冲式除垢杀菌清洗装置，由臭氧水生成机构和脉冲高压氧气输入装置构成，臭氧水生成机构连接在自来水供水管与用户管道之间，用户管道中设有水龙头，臭氧水生成机构由臭氧发生器和气液混合装置构成，气液混合装置内设有混合腔，腔内设有叶轮，臭氧发生器的供气口、自来水供水管分别与气液混合装置连接，脉冲高压氧气输入装置由阀门控制器和高压氧气源构成，阀门控制器的输入端与高压氧气源连接，输出端与用户管道中一个水龙头连接。自来水中混合臭氧，利用臭氧清洗管道中水垢，同时以脉冲形式输入高压氧气，大大提高了清除管道内水垢的效率。既达到杀菌清洗功效，又避免了药剂清洗中浪费水源、药剂残留和操作不便的问题。