本发明涉及水环境治理领域，具体涉及一种农村河道点源、面源水污染的处理系统，包括：点源净化部和面源净化部，所述点源净化部设置在河道排污口处，包括朝向岸侧的护岸坡体和朝向水侧的漂浮墙，所述漂浮墙与所述护岸坡体围成生态调节池，其中所述护岸坡体包括自上而下相连的陆地平台、潜流坡、表流坡和潜水坡，所述面源净化部为河道岸坡除去点源净化部的剩余部分，包括表流坡和潜水坡，所述点源净化部和面源净化部的表流坡和潜水坡相互连接。本发明通过对护岸坡道改造的方式在传统护岸上的排污口出设置点源净化部，在其余部分改造面源净化部，使得点污染与面污染源采用不同的方式起到分别净化的作用。