本发明公开了一种基于事件间接先于关系的科学工作流挖掘方法，该方法以XES格式描述的事件日志作为输入，以SVG格式描述的标准科学工作流文件为输出结果；首先，通过解析XES日志文件，获取所有事件序列集合，遍历事件序列集合，获得所有基于间接先于关系的事件关系对；其次，根据事件关系对进行分析，确定事件相互关系，包括事件先于关系、事件后于关系、事件并行关系，并根据所有事件关系对生成科学工作流；最后，通过传递规约操作，保证事件之间可达关系不变的情况下，获得最终精简的标准科学工作流模型。本发明挖掘的科学工作流是可靠的、完备的，即使在日志信息不完备的情况下，挖掘尽可能接近于实际的标准科学工作流。