本发明实施例提供一种入库调度的方法和系统，涉及物流及计算机技术领域，该方法包括：计算出每个存储容器相对于待入库商品的标准容纳件数；确定待入库商品的一次入库最小件数；将仓库中所有存储有该种待入库商品且标准容纳件数与已存储件数的差值不小于一次入库最小件数的存储容器按差值从大到小排序；以及按照排序结果依次选取存储容器并存入待入库商品。本发明公开的入库调度的方法和系统，在满足出库效率的条件下最大程度上满足了入库的效率。同时，在最大程度上满足入库效率的同时，避免了存储容器中的空间浪费以及储区中的空间浪费，提高了储区的存储密度。