本发明提供一种基于真值发现的三维地质模型寻优方法，包括如下步骤：S1：对同一地质体进行建模得到若干三维地质模型，对每个三维地质模型进行网格化；S2：所有三维地质模型的类型相同，若三维地质模型为三维结构模型，则将地层类型作为网格化的三维结构模型中的各个网格单元的属性值为每一网格化的三维结构模型中的每一网格单元赋值，若三维地质模型为属性模型，则直接从属性模型中获取相应网格单元的属性值为每一网格单元赋值；S3：将网格化后的三维地质模型作为输入数据分别输入真值发现算法中，推算每一网格化的三维地质模型的可靠度；S4：根据每一网格化的三维地质模型的可靠度，得到地质体的最优模型。