本发明提供了一种青少年抗疲劳功能型果醋饮料及其制备方法，将柚子果肉、绿米和苦荞麸皮进行预处理、拌料、酒精发酵、醋酸发酵、后熟、调配和灭菌灌装。由果汁调配的果醋饮料中富含糖、蛋白质、氨基酸等营养成分，能为青少年提供充足能量，促进机体生长发育。原料中的绿米和苦荞麸皮富含生物活性硒、黄酮、维生素等抗氧化成分，能快速清除青少年体内堆积的代谢产物，加快脂质过氧化物的分解，起到消除疲劳的作用。采用低温酒精发酵并在发酵后期加入乳酸菌和科氏梭菌，增加不挥发酸和酯类物质的含量，提升果醋饮料的风味。同时加入低聚异麦芽糖，促进青少年肠道内益生菌的增殖，增加维生素含量，提高机体免疫力。