本发明公开了一种基于核相关滤波的异源图像目标匹配方法，首先在参考图像中选择目标位置，然后设定初始化参数，确定检测区域并缩放图像，提取HOG特征，构建二维余弦窗和高斯窗，并对加权的二维余弦窗和高斯窗进行傅里叶变换，最终得到检测器；对待匹配图像进行参数矫正，确定检测区域，提取HOG特征，将余弦窗加权和初始化模板特征进行傅里叶变换和高斯核相关，再通过高斯核相关卷积和检测器得到相应矩阵，响应矩阵最大值即为置信度，置信度大于阈值则认为异源图像匹配成功。本发明使用了核化相关滤波，将待匹配特征映射到高维空间中进行匹配，提高了匹配的稳定性，同时用基于快速傅里叶变化的相关滤波大幅减少了匹配运算量，实现异源图像快速匹配。