本发明公开了基于个体数据的交通出行分析方法、系统及存储介质，方法包括：根据车辆出行数据确定车辆的单次出行记录；对初步提取的单次出行记录进行检验，并根据检验结果进行数据优化，得到完整的单次出行记录；所述数据优化包括修补漏检的检测记录、修改错检的记录内容；所述单次出行记录包括车辆的起点信息、车辆的终点信息以及途径的卡口信息；根据最短路径算法对所述单次出行记录进行重构，得到车辆从起点到终点的完整出行路径。本发明能够对社会车辆出行进行全面分析，得到准确的车辆单次出行信息，全面性高且准确性高，可广泛应用于计算机技术领域。