本发明涉及轨道交通客流预测技术领域，尤其涉及基于乘客出行信息的轨道交通客流预测方法和系统，其中方法包括：获取乘客出行数据，基于所述乘客出行数据，建立乘客出行信息指标体系，统计计算所述乘客出行信息指标体系中的各指标信息；基于所述乘客出行信息指标体系中计算得到的部分指标信息，估算车站内不同时段的返程客流量；将车站内乘客的返程客流量作为协变量添加至客流预测模型中，预测车站的进站客流。本发明依据乘客的多源出行数据，挖掘乘客的出行规律，在此基础上建立了乘客出行信息三级指标信息体系，实现对各指标信息的统计计算。同时提出一种面向乘客出行信息识别返程客流，并依据返程客流有效提高车站进站客流量精准度的预测方法。