本发明提供了一种样品瓶自动开合盖系统，包括样品瓶卡槽、旋转平移装置、开合盖装置、电器控制系统、安全防护装置，样品瓶卡槽设置在旋转平移装置上表面；旋转平移装置通过水平旋转将样品瓶卡槽接收的样品瓶旋转平移至开盖‑合盖位并将开合盖完成后的样品瓶旋转平移至接收‑取样位；开合盖装置设置在旋转平移装置的上方；电器控制系统与控制旋转平移装置和开合盖装置连接；安全防护装置与电气控制系统相连；本开合盖系统在工作过程中，盖子不会交叉，开盖后样品瓶会离开开盖位，使样品瓶的上部有足够空间，方便分析人员取样，开合盖旋盖器能够有效夹靠瓶盖；整体系统稳定可靠、定位准确、过程全自动。