本发明公开了一种城市环境中低慢小目标的复合拦截方法，包括输入来袭目标、拦截武器以及城市外界环境的相关信息；更新目标状态以及武器状态；进行拦截武器适宜性检验；根据动态武器目标分配模型，利用遗传算法得到第t阶段的武器目标分配方案；当拦截武器完成一次拦截，判断目标是否全消失，若是，则结束动态武器目标分配；否则，复合拦截过程进入下一阶段，即t+1阶段。本发明充分考虑城市复杂环境对各拦截武器的约束限制，将低慢小目标的来袭方式看作多波次来袭，比较符合实际作战环境，且充分考虑上一次目标分配对下一次目标分配的影响、目标当前状态的影响以及拦截武器当前状态的影响，非常符合实际的需要。