本发明涉及多自由度自组装纳米机器人及其制作控制方法，该纳米机器人由微纳米颗粒和四条脱氧核糖核酸链通过金‑巯键或链霉亲和素和生物素强相互作用，自组装而成形成四足纳米机器人。通过在硅基材料上正方形的四个顶点分别沉积圆形金电极，同时在圆形金电极上加工四个纳米孔；该尺寸的纳米孔使得在外加电场的作用下每个纳米孔将仅能捕获一条脱氧核糖核酸链。由于纳米金电极与外接电压源相连，通过调控各个纳米孔上电压的方向和大小，可以调控纳米孔上电荷密度的电性和强度，从而控制通过纳米孔的电渗流方向和强度，并与脱氧核糖核酸链所受的电场力形成联合或竞争驱动，从而控制纳米机器人的运动速度和方向。