本发明涉及一种基于标量磁力仪的弱磁矢量测量方法，包括以下步骤：（1）使标量磁力仪的光束方向与三个坐标轴的夹角相同，因此，三个坐标轴方向上的磁场和灵敏度相同；（2）分别在每个坐标轴方向上施加背景磁场，总磁场B为背景磁场与心脏磁场的叠加等。本发明的优点是：使得标量磁力仪能够测得弱磁场的矢量信息。这种方案不同于现有的特征，不需要旋转探头位置，保证了测量位置的准确。不需要增加探头数量，节约了成本。能够做到在三个测量方向上灵敏度水平相同，保证了测量矢量的准确性。因此在实用性上，有很强的优势。