本发明公开了一种基于爆燃激励辨识柴油机工作模态参数的方法及系统，辨识方法包括步骤：S1、基于待辨识柴油机的结构，布置传感器的安装点，贴装振动传感器；S2、安装柴油机及采集仪，搭建信号采集平台；S3、启动柴油机，利用燃烧室爆燃产生无规则湍流运动，在湍流主动激励作用下，对柴油机进行自激励，振动传感器采集柴油机工作状态下的振动信号；S4、采集仪从振动传感器获取所述振动信号，利用模态辨识软件对柴油机的工作模态进行辨识，获取柴油机的工作模态参数。本发明与传统的辨识方法相比，辨识的模态参数更能反映柴油机工作的状态。利用柴油机自身的爆燃特性进行激励，不需要复杂的人为设计白噪声的激励，适应柴油机的现场工作环境。