本实用新型实施例提供一种医用计算机系统，包括：第一主板、第二主板、扫描模块、切换按键、显示器和显示控制电路；显示控制电路分别与第一主板、第二主板、扫描模块、切换按键和显示器连接；第一主板和第二主板均用于输出显示数据；显示控制电路用于接收切换指令，根据切换指令选择输出至显示器的显示数据；切换按键用于接收用户输入的切换信息，将切换信息作为切换指令发送到显示控制电路；扫描模块用于扫描目标对象获取扫描结果，将扫描结果作为切换指令发送到显示控制电路。本实用新型实施例提供的医用计算机系统，设置两个主板，以同时满足两个类型工作的需求，通过扫描模块的扫描结果自动触发两个主板间的切换，集成程度高、使用方便。