本实用新型涉及发动机技术领域，尤其涉及一种船用发动机冷却系统、发动机及机动船。本实用新型中提供的船用发动机冷却系统，能够在船用发动机停止工作后对发动机内的水排出发动机内，防止温度较低的环境下管路结冰，同时还能够对热交换器内杂质进行反向吹扫，使杂质排出发动机冷却系统内，实现对管路的清理，提高清理效率。本实用新型提供的发动机，能够实现将发动机内水从发动机内排除，防止发动机内部管路在温度较低的情况下被冻裂，同时还能够实现发动机内部管路实现清理的目的，提高清理的效率。本实用新型提供的机动船，当发动机停止工作后，能够将存留在发动机内的水从发动机内吹出，防止发送管路冻裂故障，提高了该机动船的使用寿命。