本实用新型涉及手术设备领域，提供了手持式手术设备的冷却系统及手持式手术设备，该冷却系统包括：设于手持外壳的内周与电机外壳的外周之间的冷却液流道；冲洗口，沿所述手持外壳的前端内侧向所述冷却液流道延伸，并与所述冷却液流道连通；进液口，位于所述手持外壳远离所述冲洗口的一端，与所述冷却液流道连通，所述进液口处连接有冲洗管，所述冲洗管用于连接至冷却源。本实用新型通过冷却液流过环绕电机外壳外周的冷却液流道对工作中的电机进行冷却，避免电机在持续高温情况下烧坏，也能够降低手持外壳的温度，便于医护人员手持；流过电机外壳的冷却液从冲洗口喷出，可以供冷却手持外壳前端的铣钻和清理手术创面用，结构简单，操作方便。