本实用新型公开了一种无人测量船控制系统，包括无人船船体，所述无人船船体的上端外表面设置有端盖，所述端盖的一侧设置有固定座，所述固定座的上端外表面设置有风帆，所述风帆包括支撑立柱以及活动连接于外表面的连接座，所述连接座的两侧设置有支撑杆，所述无人船船体的外表面设置有气囊浮筒，所述无人船船体的内侧设置有测量仪固定装置。本实用新型所述的一种无人测量船控制系统，利用风帆提供无人测量船的动力，可以有效的节约能源，同时利用气囊浮筒增加无人测量船与水面的接触面积，可以防止无人测量船在行进中倾覆，另外利用测量仪固定装置，可以防止测量仪在船内晃动，使测量仪得到有效的保护。