本实用新型涉及冷冻技术领域，且公开了一种双层包埋微囊益生菌生产用冷冻机，包括箱体和箱盖，所述箱体内腔的中央设置有横向隔板，所述箱体的内腔沿水平等距离设置有七个纵向隔板，所述横向隔板和纵向隔板将箱体分割成多个田字形隔间，所述纵向隔板的左上角均开设有通气孔，所述横向隔板与纵向隔板组成的每个隔间的左右两侧均固定连接有冷凝固定柱。该双层包埋微囊益生菌生产用冷冻机，通过标记板、拿取槽、滑轮槽、滑柱槽、收纳槽、收纳柱等结构，使该冷冻箱的内腔被分割成多个大小相同的田字格，然后在每一个田字格中放置一个收纳柱，每一个收纳柱上又可以放置四个收纳箱，解决了生产时益生菌的冷冻量大和方便分类取拿的问题。