实用新型涉及牡丹籽加工机械技术领域，特别涉及一种有机牡丹籽壳、仁分离装置，包括机架和倾斜置于机架上的筛箱，所述机架包括分布在四角的四根支柱，两左侧所述支柱高度一致，另两右侧所述支柱高度一致，各右侧所述支柱高度低于各左侧所述支柱，各所述支柱顶端均固定连接若干堆叠在一起的扁圆状缓震垫，所述筛箱为长方体状，所述筛箱前后两侧各有两挂耳，各所述挂耳固定连接在缓震垫上，所述筛箱上方连接进料筒，下方连接出壳筒一，所述出壳筒一与筛箱连接处呈斗状，所述筛箱前侧连接振动器，所述出壳筒一连接负压风包，所述负压风包连接出壳筒二、离心负压风机。本实用新型有利于去壳后有机牡丹籽、仁的分离，提高生产效率。