本实用新型公开了生物发酵技术领域的一种多搅拌轴的生物发酵装置，包括箱体、箱盖和多轴搅拌组件，多轴搅拌组件包括搅拌电机和第一搅拌轴，第一搅拌轴的外侧转动连接有第二搅拌轴，底端固定有刮板，第二搅拌轴的顶端通过齿轮和齿圈与箱盖连接，本实用新型通过搅拌电机带动第一搅拌轴转动，第二搅拌轴通过连接杆的作用绕第一搅拌轴转动，同时通过齿圈和齿轮的作用，使第二搅拌轴自转，通过第一搅拌轴和第二搅拌轴的多轴搅拌，使搅拌和混和更加快速、效果更好；刮板随第一搅拌轴同步转动，搅拌的同时，通过刮板对沉积于箱体底面的物料进行刮动，避免物料粘附或沉积于箱体底部不能充分混合。