本实用新型公开了一种多不饱和脂肪酸微胶囊干燥装置，包括喷粉干燥机、热风炉及流化干燥床，所述喷粉干燥机的出料口与所述流化干燥床的进料口相连，所述热风炉的出风口与所述喷粉干燥机的进气口相连，其特征在于：还包括热交换器、冷凝器、除湿器及氮气主管，所述氮气主管的两端分别与流化干燥床的进气口及出气口相连，所述冷凝器及除湿器安装于所述氮气主管上，所述除湿器靠近所述流化干燥床的进气口设置，所述冷凝器靠近流化干燥床的出气口设置，所述氮气主管上设有氮气进口，所述氮气进口设置于所述除湿器与所述流化干燥床之间。本实用新型降低了能耗，节约了成本。