一种胃肠镜专用清洁手指套，包括大拇指套，大拇指套底端布置有虎口套，虎口套左部上端布置有食指套，大拇指套、虎口套和食指套的材质相同且均由透气吸水材料制成，以大拇指套为例，大拇指套从外到内依次包括表层、芯层和底层，表层和芯层之间设置有网格层和导流层，网格层内布置有多个上连接板，芯层和底层之间设置有吸水树脂层和棉布层，吸水树脂层内布置有多个下连接板，芯层内布置有多个空心管，空心管内填充有杀菌颗粒。本实用新型中该清洁手指套穿脱方便，且能快速吸收通过胃肠道流出的液体，且该清洁手指套为手指形状，因而不影响医生正常操作，吸收量大，能有效清洁，提升医生操作时的舒适度，进而提高操作效率，并且能减少材料消耗。