一种银杏多肽低温超滤机，包括机架和超滤机桶体，超滤机桶体包括外层桶壁和内层桶壁，外层桶壁和内层桶壁之间设有保温层，保温层设有用于制冷的半导体制冷片，超滤机桶体的顶部内壁竖直设有一转轴，转轴上设有叶片，转轴连接设于所述超滤机桶体上方的电机输出端，超滤机桶体的顶部设有进料口和进气口，进气口连接气泵，超滤机桶体中于转轴的下方依次设有初滤膜和超滤膜，超滤机桶体的底部设有出料口。本实用新型通过在超滤机中加设搅拌装置，使得银杏酶解产物中的大颗粒杂质得到向上运动的力，减少对初滤膜的堵塞；加设低温控制系统，可以保持银杏酶解产物较长时间的过程不会出现变质。