本实用新型公开了一种肝素结合蛋白提取装置，涉及提纯技术领域，为解决现有的肝素结合蛋白提取装置在提取的纯度上较为缺乏，从而在进下一步的实际操作时，影响到反应的结果最终导致实验或者生产上失败的问题。所述搅拌机构的上端面上设置有伺服电机，所述伺服电机的一侧设置有进料口管道，所述搅拌机构的下方设置有第一柱脚，且第一柱脚设置有四个，所述搅拌机构的前端面上设置有第一观察窗口，所述第一观察窗口的一侧设置有开关键，所述搅拌机构的一侧设置有输送泵机构，所述输送泵机构的一侧设置有连接管道，所述搅拌机构内部的上方设置有输出端，所述输出端的下方设置有中心旋转轴。