本实用新型公开了一种肝素分离提取装置，包括搅拌罐体、控制器、酸碱剂箱组、粉碎搅拌电机、物料预处理筒体、限位隔网层、搅拌轴和粉碎下料轴，所述搅拌罐体的侧面固定安装有所述物料预处理筒体，所述搅拌罐体的内侧横向隔设有所述限位隔网层，所述限位隔网层将所述搅拌罐体分割为液体搅拌腔和限位腔，所述物料预处理筒体的底部通过所述连通管连接到所述限位腔内，所述限位隔网层上安装有网层轴套，所述网层轴套内竖直插接有所述搅拌轴，所述搅拌轴的顶部伸接到所述搅拌罐体的外侧。有益效果在于：本实用新型可以将物料进行预处理粉碎，通过一体罐的搅拌和调节进行分离液的制作排出静置，残留废渣限位在底部，便于定期清理。