本发明给出了一种用于重合轨迹的分析方法和系统，包括基于轨迹信息库获取待分析基准轨迹集合，并根据发生时间将待分析基准轨迹集合划分为多个子集合；利用预设的分析间隔阈值将子集合中的轨迹等分，利用随机数作为等分点的半径获取等分点的轨迹相似圈；遍历待分析基准轨迹集合以及轨迹相似圈，利用比对属性和发生时间获取轨迹信息库中与等分点的轨迹相似结果集合，并利用轨迹相似结果集合的交集获得重合轨迹的结果集合Zn。该用于重合轨迹的分析方法和系统基于海量数据场景下，可以自动分析出与特定轨迹重合的未知轨迹，并及时预警，大大降低了人工分析研判的工作，分析效率高。